Nos jogos Mortal Kombat: Deadly Alliance, Mortal Kombat: Deception e Mortal Kombat: Armageddon, Alternate Costumes são segundas roupas para os personagens. Elas servem para revelar mais sobre a história de cada um, como por exemplo, a de Drahmin em Deadly Alliance revelou o que há embaixo de sua máscara: seu rosto mumificado. Por vários jogos, elas erão primeiramente compradas na Cripta, mais em Deception e Armageddon elas também são achadas no modo Konquest. Porém, em Mortal Kombat Gold também é possível ter uma, só que ela já vem com o personagem.
No novo jogo da série, todos os personagens tem uma roupa alternativa, porém, quando a edição especial do jogo é comprada, é recebido um cartão com um código para liberar uma roupa clássica/nova para algum personagem (tal como Jade, Ermac e Scorpion). Ao completar a última missão da Torre dos Desafios, uma 3º roupa alternativa para Mileena chamada Flesh Pits é liberada.