El Nintendo 64, consola casera de Nintendo, solo lanzó 2 juegos de peleas de Mortal Kombat y uno de modo de aventuras.
| Imagen | Nombre | Lanzamiento | |
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Mortal Kombat Trilogy | 1996 | |
| Incluye a Khameleon, menos escenarios, no incluye a Sub-Zero, no incluye a los Sub-Jefes, tanto Motaro como Shao Kahn poseían Fatality, y algunos personajes tenían tres Fatality. | |||
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Mortal Kombat 4 | 1997 | |
| En los finales de los personajes se muestran videos que presentan escenas de los últimos acontecimientos ocurridos en el juego. Incluían a Goro. | |||
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Mortal Kombat Mythologies: Sub-Zero | 1997 | |
| En el modo narrativo ofrece imágenes estáticas de videos con subtitulos de los diálogos. | |||